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barcode(barcode是什么意思啊)
9个月前 (07-17) 类别:影音播放
- 发布日期:2025-04-20 13:13:26
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barcode(barcode是什么意思啊)介绍
尊敬的读者,barcode是当前备受关注的话题,但许多人对其仍存在疑惑。在本篇文章中,我将为你提供清晰的解释和深入的分析,希望能满足你的求知欲望。
高通量测序中的Barcode 介绍
高通量测序中的Barcode:精确定位数据的“身份证”
在高通量测序技术的世界里,illumina公司的测序平台,如Hiseq-2000,以其强大的测序能力引领着行业发展。每个flowcell的8条lane,每条lane的测序数据量高达44G,然而,对于特定类型的测序任务,如外显子组测序,其只需要大约64M的测序区域和200X的深度,总计仅13G数据。这意味着一个lane足以同时处理多个样品,这就引出了一个关键问题:如何在海量数据中精准区分不同的样本?这就是Barcode的登场时刻。
测序数据的语言与单位
测序数据的基石是碱基序列,由“A、T、G、C”这四种基本组成单元表示。数据量通常用k(10^3)、M(10^6)和G(10^9)来衡量,以人全基因组为例,其大小约为3G。而计算机存储单位则遵循1024进制,这使得测序数据与计算机存储空间有了直观的对应关系,尽管两者单位换算有所不同。
Barcode的必要性
为了避免测序资源的浪费,多个样品被混合在一个lane上进行测序。这就需要一种“标签”,即Barcode,来标记每一份样品,确保在后续数据分析时能够准确地分离和识别出不同的样本数据。Barcode就像是测序中的样本“身份证”,确保每一份数据都能找到自己的归属。
测序原理与实践
以illumina的Hiseq平台为例,测序前的步骤包括构建library(文库):首先对mRNA进行片段化,然后筛选出特定大小的片段(例如RNA-seq的200bp,DNA-seq的500bp),接着加上正向和反向接头,通过PCR扩增后再进行测序。每个Barcode的设计既要兼顾碱基平衡又要满足激光平衡,以确保最佳的分离效果。
选择最佳Barcode的准则
碱基平衡要求Barcode的四种碱基(A、T、G、C)比例均衡,如理想情况下为1:1:1:1,以保证所有样本的区分。激光平衡则是指每个碱基位的组合应尽可能保持A+C与G+T的平衡,以适应测序仪的激光系统。当样本数少于4种时,需要调整策略,确保至少包含激光平衡的Barcode组合,如Illumina推荐的12个或更复杂的3重、6重组合。
实例解析与扩展
例如,Illumina的推荐barcode组合,如ATCACG、CGATGT等,每个位置的碱基比例接近理想状态。而在样本数不足时,采用2重、3重或6重组合,如6号barcode和12号barcode的内核组合,保证了基本的样本分离。除此之外,还有其他研究机构如康奈尔大学和华中农业大学也提供了针对不同酶的Barcode设计,展现出了Barcode选择的多样性和灵活性。
总的来说,Barcode在高通量测序中扮演着至关重要的角色,它确保了数据的精确识别和有效利用,是实现多样本测序的关键技术。通过精心设计和选择,我们能在海量数据中找到每个样本的独一无二的“身份证”。
barcode是什么意思啊
barcode在英语中代表"条形码"的意思。
barcode的释义:
1.条形码:
例句:However, our factory workers were neglectful and did not use the stickers with barcode on。
翻译:但是厂里疏忽了,没有用上有条形码的那种卡头。
来源:在线英语词典;
用法及短语示例:
barcode一般作为名词使用,在常见短语或俚语中出现较多。
英语例句:
1. Two core elements of this thesis are OMR information card and barcode identification。
翻译:条形码的识别和OMR信息卡的识别是本文的两个核心内容。
2. Two approaches that look as if they can help are OCR and barcode scanning。
翻译:有两种方式看上去会有所帮助,它们是OCR和条形码扫描。
3. When you open Barcode Scanner, you will see a rectangular area with a flashing red line displayed on the screen of your phone。
4. This is part of a$50 bill like Billy's with the hidden barcode。
翻译:这是50元钞票的一角跟比利的新钞票一样有密码。
5. Barcode generation APis can be used to generate barcodes with the data provided。
翻译:可以使用条形码生成API利用提供的数据生成条形码。
6. And so it is not any one stripe or something that tells me i have a virus of a particular type here; it's the barcode that in bulk represents the whole thing。
barcode是怎样组成数字的呢
条码是由一组规则排列的条、空以及对应的字符组成的标记,“条”指对光线反射率较低的部分,“空”指对光线反射率较高的部分,这些条和空组成的数据表达一定的信息,并能够用特定的设备识读,转换成与计算机兼容的二进制和十进制信息。通常对于每一种物品,它的编码是唯一的,对于普通的一维条码来说,还要通过数据库建立条码与商品信息的对应关系,当条码的数据传到计算机上时,由计算机上的应用程序对数据进行操作和处理。因此,普通的一维条码在使用过程中仅作为识别信息,它的意义是通过在计算机系统的数据库中提取相应的信息而实现的。码制即指条码条和空的排列规则,常用的一维码的码制包括:EAN码、39码、交叉25码、UPC码、128码、93码,及Codabar(库德巴码)等。
barcode是什么意思
barcode的意思是:条形码。
条形码(barcode)是将宽度不等的多个黑条和空白,按照一定的编码规则排列,用以表达一组信息的图形标识符。常见的条形码是由反射率相差很大的黑条(简称条)和白条(简称空)排成的平行线图案。
条形码可以标出物品的生产国、制造厂家、商品名称、生产日期、图书分类号、邮件起止地点、类别、日期等许多信息,因而在商品流通、图书管理、邮政管理、**系统等许多领域都得到广泛的应用
条形码技术(barcodetechnology,BCT)是在计算机的应用实践中产生和发展起来的一种自动识别技术。它是为实现对信息的自动扫描而设计的,它是实现快速、准确而可靠地采集数据的有效手段。
条形码技术的应用解决了数据录入和数据采集的瓶颈问题,为物流管理提供了有利的技术支持。条形码是由一组规则的条空及对应字符组成的符号,用于表示一定的信息。
条形码技术的核心内容是通过利用光电扫描设备识读这些条形码符号来实现机器的自动识别,并快速、准确地把数据录入计算机进行数据处理,从而达到自动管理的目的。条形码技术的研究对象主要包括标准符号技术、自动识别技术、编码规则、印刷技术和应用系统设计5个部分。
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